Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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