Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXC1Q12948 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
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FOXC1Q12948 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXC1Q12948 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXC1Q12948 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXC1Q12948 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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FOXC1Q12948 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXC1Q12948 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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