Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCAPQ12770 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms