Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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PGGT1BP53609 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PGGT1BP53609 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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