Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRMP28827 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PTPRMP28827 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRMP28827 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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