Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRDP23468 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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