Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTPRBP23467 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms