Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SEMA3EO15041 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms