Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NEDD1Q8NHV4 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms