Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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HERC1Q15751 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC1Q15751 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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