Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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PDCD1Q15116 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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