Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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