Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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