Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FOXD4Q12950 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms