Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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