Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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