Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXA3O43365 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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