Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CDKN3Q16667 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CDKN3Q16667 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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