Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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RPE65Q16518 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RPE65Q16518 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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