Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SKIV2LQ15477 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SKIV2LQ15477 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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