Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms