Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
IHHQ14623 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
IHHQ14623 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms