Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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CDH18Q13634 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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CDH18Q13634 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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CDH18Q13634 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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CDH18Q13634 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CDH18Q13634 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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