Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NME3Q13232 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
NME3Q13232 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
NME3Q13232 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms