Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms