Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPREP23469 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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PTPREP23469 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTPREP23469 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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