Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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PTPRAP18433 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTPRAP18433 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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