Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFXAPO00287 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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