Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SHOC2Q9UQ13 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms