Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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UBXN4Q92575 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
UBXN4Q92575 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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