Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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