Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SS18Q15532 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SS18Q15532 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SS18Q15532 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SS18Q15532 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SS18Q15532 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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SS18Q15532 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SS18Q15532 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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SS18Q15532 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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