Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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