Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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BRD3Q15059 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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BRD3Q15059 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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BRD3Q15059 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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BRD3Q15059 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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