Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
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CHD4Q14839 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CHD4Q14839 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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CHD4Q14839 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHD4Q14839 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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