Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PMS2P11Q13670 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PMS2P11Q13670 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms