Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTCH1Q13635 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTCH1Q13635 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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