Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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