Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
BPTFQ12830 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
BPTFQ12830 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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