Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IFFO1Q0D2I5 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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