Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PDE4DQ08499 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms