Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CXCL3P19876 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms