Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRCP08575 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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