Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CIPCQ9C0C6 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CIPCQ9C0C6 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CIPCQ9C0C6 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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