Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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