Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
USF2Q15853 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USF2Q15853 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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