Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC85BQ15834 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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