Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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SEC23BQ15437 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEC23BQ15437 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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