Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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SYCP1Q15431 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SYCP1Q15431 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
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