Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PDCD1Q15116 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms